458 papers
Deze studie toont aan dat eenzijdige kruisvoeding de adaptieve evolutie van zowel de producerende als de consumerende bacteriesoort beperkt door sterkere zuiverende selectie en een verhoogde afhankelijkheid, zelfs wanneer de fitnessvoordelen niet wederzijds zijn.
Dit artikel introduceert een nieuwe Bayesiaanse maatstaf voor de fylogenetische informatiewaarde, gebaseerd op geodetische afstanden in boomruimte en de relatieve variantie tussen prior- en postverdelingen, die toepasbaar is op zowel gesimuleerde als empirische data om ook informatieconflict tussen datasets te kwantificeren.
Deze studie toont aan dat fotosynthetische algen in de ciliaat *Paramecium bursaria* fungeren als cruciale organisatoren van de dagelijkse genexpressie van de gastheer, waarbij ze een uitgebreid ritmisch transcriptoom aansturen dat afhankelijk is van fotosynthese en ook voorkomt bij andere symbiotische protisten.
Dit onderzoek toont aan dat de wereldwijde invasies van ambrosiakevers worden gestructureerd door een combinatie van inteelt, die schadelijke mutaties kan ophopen, en hybridering tussen lijnen, wat de reiniging van deze genetische last mogelijk maakt en een aanzienlijke bioveiligheidsdreiging vormt.
Dit onderzoek onthult dat geografische variatie in de maan-gecoördineerde paaitijd van de graspuer (Takifugu alboplumbeus) langs de Japanse kust wordt veroorzaakt door verschillen in het circadiane ritme, die worden gekoppeld aan specifieke genetische varianten in het gen *prrt1l*.
Deze studie toont aan dat *Fasciola hepatica*-populaties in het VK, die runderen en schapen infecteren, een beperkte genetische structuur vertonen en een hoge genstroom ervaren, wat wordt ondersteund door de identificatie van voornamelijk gedeelde ampliconsequentievarianten in mitochondriale genen.
Dit onderzoek toont aan dat bacteriële genregulatie via exaptatie kan evolueren doordat gladde adaptieve landschappen het mogelijk maken om nieuwe transcriptiefactorbindingsplaatsen te vormen via kleine, adaptieve mutaties, waarbij transcriptiekruisverontreiniging een cruciale rol speelt in de diversificatie.
Dit onderzoek toont aan dat in *Drosophila melanogaster* aanzienlijke genetische variatie kan blijven bestaan onder intense selectiedruk, mede door evenwichtselectie, en dat deze variatie snel kan worden hergebruikt wanneer de selectierichting wordt omgekeerd.
Een heranalyse van het oude DNA uit de Mazongshan-site (400-160 v.Chr.) weerlegt de oorspronkelijke claim dat er hinnies aanwezig waren en identificeert de vier vermeende hybriden in plaats daarvan als ezels, waardoor er momenteel geen genetisch bewijs is voor hinnies op deze locatie.
Deze studie beschrijft de kleurloze stramenopile *Ciliophrys* sp. Baltic, die door reductieve evolutie zijn plastide heeft verloren maar een bacteriële endosymbiont (*Candidatus* Penulousia baltica) herbergt die de gastheer helpt bij het compenseren van biosynthetische tekorten.
Deze studie toont aan dat een geometrische analyse van dominantieparameters onthult dat stabiele polymorfie onder antagonistisch pleiotropie veel breder mogelijk is dan eerder werd aangenomen, omdat de voorwaarden niet afhankelijk zijn van sterke selectie of dominante omkeringen.
Deze studie toont aan dat het dendritische transcriptoom van muizen en ratten sneller evolueert dan dat van het soma, wat wijst op subcellulaire systeemdrift die de mosaïekevolutie van neurale synaptische functies aandrijft terwijl de kernrollen behouden blijven.
Dit onderzoek toont aan dat bij de uitbreidende Kelletia kelletii-soort, hoewel de genenstroom hoog is, de overleving van lokaal voortgebrachte jongen in het nieuwe verspreidingsgebied groter is dan die van migranten, wat wijst op een selectief filter na de vestiging dat de regionale verbondenheid en overleving beïnvloedt.
Ondanks de verwachting van snelle adaptieve evolutie, tonen analyses van drie microneme-eiwitten (MIC13, MIC12 en MIC16) in *Toxoplasma gondii* aan dat deze voornamelijk onderhevig zijn aan zuiverende selectie en functionele conservatie, terwijl hun fylogenetische geschiedenissen onderling incongruent zijn.
Dit onderzoek toont aan dat geprogrammeerde DNA-eliminatie door chromosoomfragmentatie wijdverbreid voorkomt bij vrijlevende Rhabditidae-nematoden, waarbij bewijs werd gevonden in 17 van de 25 onderzochte soorten.
Dit fylogenomische onderzoek, dat gebruikmaakt van fossiel-geboorte-dood-datering, onthult dat de diversificatie van de cicadenfamilie (Cicadidae) voornamelijk plaatsvond na het K-Pg-massalextinctie-evenement, waarbij vier van de vijf subfamilies kort daarna wereldwijd diversificeerden.
Deze studie toont aan dat, ondanks de extreme genealogische discordantie binnen het geslacht *Sebastes*, het toepassen van een phyloGWAS-framework met accurate genetische verwantschapsmatrices succesvol varianten kan identificeren die geassocieerd zijn met levensduur.
In dit onderzoek wordt de evolutie van organellen in eustigmatophyten belicht door 51 nieuwe genoomsequenties te analyseren, wat leidt tot een robuuste fylogenie, een beter begrip van de stabiliteit van plastiden versus de diversiteit van mitochondria, en de identificatie van nieuwe, eustig-specifieke mitochondriale genen en tRNA-functies.
Dit onderzoek toont aan dat de vorming van RNA-ligandcomplexen, waarbij hoge affiniteitsstructuren tijdelijk worden gesequestreerd en via thermische fluctuaties worden aangevuld, de evolutionaire voorkeur voor uiterst stabiele structuren vermindert en zo RNA-moleculen helpt om neutral confinement te ontsnappen en hun structurele diversiteit te behouden.
Dit onderzoek toont aan dat genomische architectuur en epistatische interacties gezamenlijk de dynamiek en voorspelbaarheid van polygenische adaptatie bepalen, waarbij een hoger aantal chromosomen de parallelle evolutie bevordert door recombinatie van gecoöpteerde allelen, terwijl chromosomale fusies in de 4-chromosoom-klade leiden tot vertraagde en minder herhaalbare responsen.